O Congresso Nacional é o órgão máximo da JSD, sendo a assembleia representativa de todos os seus militantes. Tem por objectivos fundamentais a definição das grandes linhas orientadoras da atuação política da JSD e a organização dos seus militantes.
O Conselho Nacional é o órgão responsável pela orientação política geral da JSD definida em Congresso, bem como pela fiscalização da ação dos órgãos nacionais da JSD.
A Comissão Política Nacional (CPN) é o órgão executivo superior da JSD e tem como atribuições assegurar a direção permanente da JSD, garantir o cumprimento da linha política aprovada pelo Congresso Nacional e zelar pelo regular funcionamento da JSD.